Za razliku od IVF postupka, ICSI metodom se bira jedan spermatozoid koji će se pomoću mikromanipulatora plasirati u jajnu ćeliju.
Ova tehnika oplodnje se sprovodi u slučaju postojanja lošeg kvaliteta i broja spermatozoida ili nakon punkcije testisa kod azoospermie (nema spermatozoida u ejakulatu).
Takođe se primenjuje i kod parova gde nije bilo uspešnog IVF tretmana, a prolazi se kroz sve faze kao u klasičnom IVF. Šanse za uspešnom trudnoćom su 40-45%.